{"ObjectType":101,"Sequence":1944,"PreHash":"6630321CB891216C2AC13770591F2B07","Content":"\r\n\r\n# Omicron: 毒王族谱（2023年1月10日第三次更新）\r\n\r\n[ 新潮沉思录 ](javascript:void\\(0\\);)\r\n\r\n__ _ _ _ _\r\n\r\n以下文章来源于拍帮主的后花园 ，作者拍老师\r\n\r\n\r\n**拍帮主的后花园** . I told you so……\r\n\r\n\r\n\r\n** 文 | 拍老师 **\r\n\r\n** \r\n**\r\n\r\n \r\n\r\n \r\n\r\n\r\n各位晚上好。 感谢各位不停催更，跳票多日的毒王族谱系列，今天终于返场了…… 顺便，上一集请见： [\r\n《Omicron：毒王族谱（2022年10月16日第一次更新）》\r\n](https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxODI3NzY1Mg==&mid=2247497797&idx=1&sn=f04a04e148bbe64ff7f8e0e7b43c362a&chksm=c1b1633ef6c6ea28a1372e03e35fe9ca12ee3afd55cb5c0791340a6eee0d836d5bd43c5ddbca&token=893538990&lang=zh_CN&scene=21#wechat_redirect)\r\n。 \r\n \r\n\r\n* * *\r\n\r\n \r\n首先是变异株数量。\r\n\r\n * 2022年9月22日，本系列第一集时， Omicron大家族（除了BA.1之外）总共 **298个** 子分支； \r\n * 到了2022年10月15日，本系列第二集时，这个数字飙到了 **464个** ； \r\n * 而截止今天（2023年1月10日），Omicron大家族（除了BA.1）一共拥有 **673个** 子分支。 \r\n\r\n \r\n以上673个子分支当中， 以近两个月BQ. 1的增速作为基线的话， 有大概60个子分支处于增长状态~\r\n（是的各位你们没看错，BQ.1已然沦为背景板啦） \r\n \r\n如下图所示，上述60多个子分支集中分布在6个亚谱系，即：\r\n\r\n * BA.2.3.20*亚谱系； \r\n\r\n * BA.2.75*亚谱系； \r\n * BQ.1*亚谱系； \r\n\r\n * XBB*亚谱系； \r\n\r\n * 两个Deltacron亚谱系（不过严格来说XBC*和XAY*都还算不上谱系）； \r\n * 以及BA.5亚谱系的一些余孽。 \r\n\r\n \r\n——请品鉴： \r\n \r\n\r\n* * *\r\n\r\n \r\n下面咱们 从每个 亚谱系代表队 挑几个 尖子生出来 点评点 评吧。 \r\n \r\n——首先是BA.2.3.20*代表队，请品鉴：\r\n\r\n简单解释一嘴：\r\n\r\n * 上图是巴塞尔大学Richard Neher老师借用演化树的UI做出的变异株树状列表； \r\n * 其中每一个小圆点并不代表真实的测序记录，而代表了取得了Pango委员会正式命名的子分支； \r\n * 小圆点的颜色则代表取得正式命名的时间先后，其中越偏红色则越晚近。 \r\n\r\n \r\n所以这里重点提几句鲜红色的那几种：\r\n\r\n * ** CM.10 ** ，比原始版BA.2.3.20额外多出刺突蛋白V445A和K478T回复突变，按照Cornelius小哥最先提出的天阶序论（延伸阅读，见 [ 这里 ](http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU0MTA3ODA4NQ==&mid=2247491842&idx=1&sn=861173d80ed16a4cb49acd5dcfcdd94d&chksm=fb2dc628cc5a4f3ef93cc8618f6390a68062cc94f685ea1891847774d489d34aca2320e1e447&scene=21#wechat_redirect) ），算是七阶高手； \r\n * ** CM.11 ** ，比原始版BA.2.3.20额外多出刺突蛋白R346T和F486S，一举迈入 **八阶** 境界（但由于绝对数量还太少，所以增速暂时不明）； \r\n * ** BA.2.3.22 ** ，这个不是BA.2.3.20的子分支，但作为近邻，顺便提一嘴得了……总之这是BA.2亚谱系下最新的一个跃迁突变变异株，拥有11个额外突变，其中8个出现在刺突蛋白，分别是：69/70del, W152L, 211del, L212I, **R346T,** N417T回复突变 **, F490A** , A942S。BA.2.3.22很可能起源于菲律宾，随后在卡塔尔等地检出，目前在德国流行。 \r\n\r\n \r\n\r\n* * *\r\n\r\n \r\n——接下来有请BA.2.75*代表队，请再品鉴：\r\n\r\n\r\nBA.2.75* 代表队过于枝繁叶茂，以至于一张图根本放不下…… 上面两张 图分别是BM*（包括 CH *） 和B N*两大分支 。 \r\n其中值得留意的最新种子选手包括： \r\n\r\n * ** CH.1.1.2 ** ，比CH.1.1额外多次S:T883I，当前整个BA.2.75*大家族的增速冠军； \r\n\r\n * ** CH.1.1.4 ** ，各方大佬正在密切关注的一个子分支，这货整个Omicron家族第一个稳定拥有S:P681R突变并能保持适应性的变异株（毕竟大伙儿都还记得当初2021年被P681R支配的恐惧……）； \r\n * ** CH.3.1 ** ，已喜提S:F486P，并且一口气额外获得S:S494P； \r\n * ** DS.1 ** ，除了CH.1.1.2之外，BA.2.75*大家族另外一个值得留意的最新种子选手。比BN.1.3.1额外多出了刺突蛋白R403K和F486S； \r\n\r\n * ** BN.1.3.2 ** 和 **BN.1.3.4** ，双双喜提超强增益突变S:V445A，一同跻身七阶。 \r\n\r\n \r\n\r\n* * *\r\n\r\n \r\n——然后是BQ.1*代表队，请继续品鉴：\r\n\r\n如上图BQ.1* 代表队的全新一代种子选手主要集中在BQ.1.1*分支，包括：\r\n\r\n * ** BQ.1.1.34 ** 和 **DT.1** ，这俩通过不同的演化路径获得了趋同的刺突蛋白144del跟S494P突变，并双双名列家族内部增速榜顶端； \r\n * ** DP.1 ** ，获得了罕见的刺突蛋白A352S突变，同样增速靠前。 \r\n\r\n \r\n\r\n* * *\r\n\r\n \r\n——下面是XBB*代表队登场：\r\n\r\n大伙儿想必已经听说了，XBB.1在北美喜提关键的S:F486P增益突变之后，如同战神附体，一举取代BQ.1.1，获得美帝主流株地位~\r\n然而大伙儿可能还没听说的是，XBB大家族其他成员也在纷纷获得F486P…… 其中最新中奖的种子选手是 ** XBB.1.9.1 ** 和 **\r\nXBB.6. 1 ** 。 \r\n\r\n* * *\r\n\r\n \r\n——然后在瞅瞅XBC*和XAY两支德奥合并代表队：\r\n\r\n\r\n * ** XBC.1.2 ** 及 **XBC.1.2.1** ：靠着ORF1a的增益突变（T3255I）成功进入增速榜第二梯队； \r\n * **XBC.1.1.1** ：喜提强力增益突变S:G476S，加入趋同演化的列强行列； \r\n * ** XAY.1.2 ** 和 **XAY.3** ：虽然刚刚获得命名，但势头反而不如2022年底就已经冒头的XAY.2……后者正在丹麦打村战呢（详见： [ 《论，村战》 ](http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU0MTA3ODA4NQ==&mid=2247494070&idx=2&sn=1e8903f8077d731833a885c0388d88fd&chksm=fb2dce9ccc5a478a8e34c7ffa2afb7c4048460afe691ede1cb6f35d316d6da4bdbef81a72739&scene=21#wechat_redirect) ） \r\n\r\n \r\n\r\n* * *\r\n\r\n \r\n——最后是一些BA.5的余孽：\r\n\r\n**CK.1.1和CK.1.2** ：同属BA.5.2.24分支~ \r\n——以及……请自行品鉴：\r\n\r\n** BF.7.14 ** 、 **BA.5.2.48** 和 **BA.5.2.49** …… 懂的都懂吧，这里就不解说了。 \r\n \r\n以上就是最新一期毒王族谱当中值得关注的新发变异株们。 虽然这些新发毒株个个看起来都挺阴间， 但正如之前强调的，现在已然是菜鸡互啄的村战时代了……\r\n等待上面这些新一代种子选手的命运，很有可能就是村战的泥潭。 \r\n——请品鉴：\r\n\r\n↑ 德法英三国村战示意图，来自Tom Wenseleers老师。 以大英 为例，虽然XBB.1.5的相对增速最快，\r\n但最后流行率却只能跟CH.1.1打成平手，各占三成出头。 而且到了那时候，很可能市面上早就有下一代变异株了…… \r\n呵呵，这内卷的泥潭。 \r\n \r\n\r\n\r\n\r\n预览时标签不可点\r\n\r\n微信扫一扫 \r\n关注该公众号\r\n\r\n\r\n\r\n\r\n\r\n****\r\n\r\n\r\n\r\n****\r\n\r\n\r\n\r\n× 分析\r\n\r\n 收藏\r\n\r\n","Timestamp":1673539200000,"PublicKey":"0319773E4E75194DE9810E624C4B2B57BD976F8E62CF12ACC85909BABF216A6406","Signature":"3044022006481C9B0EED1D017AC3AD96AC567D816473476476541A09228273F1E84E16C402204E69B384E6CDAA3017A8F6D84A8604B88AA5A0BC0257A6035C65F85C204D2930"}