{"ObjectType":101,"Sequence":2138,"PreHash":"2C227E51502619ACDB4593BCE4B4A72F","Content":"\r\n\r\n# 巴塞尔报告（第十四期，by Nekromanzer）\r\n\r\n[ 新潮沉思录 ](javascript:void\\(0\\);)\r\n\r\n__ _ _ _ _\r\n\r\n以下文章来源于拍帮主的后花园 ，作者拍老师\r\n\r\n\r\n**拍帮主的后花园** . I told you so……\r\n\r\n 文 | 拍帮主 \r\n\r\n \r\n\r\n** 各位晚上好， ** ** 本期的《巴塞尔报告》，又由微博老铁@Nekromanzer老师搬运，鸣谢！ ** ** 照惯例，格式有微调。 **\r\n** 上集请见： [ 《巴塞尔报告，第十三集》\r\n](https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU0MTA3ODA4NQ==&mid=2247496714&idx=1&sn=c913d9f93e33e8e1b9ac0ca157f4eccc&chksm=fb2dd320cc5a5a36ecf5566b90264138ada1f7f6439e8ec4b28e00056c2e67675658e8112a23&token=1203180603&lang=zh_CN&scene=21#wechat_redirect)\r\n** \r\n \r\n\r\n* * *\r\n\r\n \r\n**第一部分，宏观趋势，** XBB*愈发稳固的支配地位 ** **\r\n**\r\n** XBB*称霸全球的趋势仍在继续， 非XBB*株从2月底的30-35%到3月底的15-20%，再到4月底就只剩5-10%了。 \r\n不光如此，顽固的东亚怀旧服也被XBB*攻克了，无论是在国内、日本还是韩国都是如此，要知道上一期巴塞尔报告中，这三个地方的非XBB*毒株仍占相当大的比例。 \r\n\r\n↑ 以上是cov-spectrum平台用!XBB*（非XBB家族毒株）查询得到的各地近6月测序中非XBB*的占比。 \r\n可以看到，不管是哪个大区玩得哪个服，最后统统都被XBB*给合并了。\r\n除了大洋洲尤其是纽村在4月初非XBB*还有40%左右的占比，其它地区都已经跌到20%以下了。 \r\n\r\n* * *\r\n\r\n \r\n**第二部分，** 非XBB*的顽固分子们 ** **\r\n \r\n** BN.1* (=BA.2.75.5.1*) '九头蛇/Hydra' ** \r\n目前只有国内的BN.1*逆时上扬，近期达到了4%的占比，但是XBB*的增速要远比它快。此前的东亚其它怀旧服中（日韩）BN.1*能够占有一席之地，但是近期被XBB*打得丢盔弃甲。\r\n其中值得注意的是在国内的 **FR.1** [即BN.1.2.3加上额外的S:K187E(A22121G)]。 \r\n \r\n**CH.1.1* (=BM.4.1.1.1.1*=BA.2.75.3.4.1.1.1.1*) '暮光双头犬/Orthrus** ' \r\n目前仍在欧洲和大洋洲流行，尤其是纽村和丹麦。 其中值得注意的是 **FK.1*** [即CH.1.1.17加上额外的S:D215G(A22206G),\r\nS:Q613H(G23401T)]，在土澳、纽村和丹麦的势头都不错。 \r\n \r\n**BA.2.3.20* '蛇尾鸡/Basilisk'** \r\n此前盘踞菲律宾，不过没有那里近期的数据。 其中值得注意的是 **FV.1** [即CM.8.1.1加上额外的S:K147N(A22003T),\r\nS:R346T(G22599C), S:G446S(G22898A), S:F486S(T23019C)]，在东亚以及东南亚有上升的趋势，不过市占率还不高。 \r\n \r\n**XBC*** \r\n还在流行的两款德尔塔克戎之一，在菲律宾与土澳较为常见。 其中值得注意的是 **XBC.1.6**\r\n[即XBC.1加上额外的S:R346S(A22600T), S:L452R(C22916A, T22917G)]，不过暂时没有大规模从土澳输出的迹象。 \r\n \r\n**XAY*** \r\n另一款流行的德尔塔克戎，南非出品(不过在原产地已经消失)，在德国和丹麦站稳了脚跟。\r\n其中值得注意的是XAY.1.1*，它同样具有S:L452R(C22916A, T22917G), F486P(T23018C,\r\nT23019C)，以及S:R346T(G22599C)， 在德国一直能够维持1%左右的占比，全球各地偶有发现，但是似乎没有增长的趋势。 \r\n \r\n**BA.5*** \r\n包括BF*和BQ*在内，BA.5*继续下滑的趋势。 \r\n \r\n\r\n↑ 非XBB*死硬派们的地区流行率以及全球占比。 \r\n \r\n\r\n* * *\r\n\r\n \r\n**第三部分，** XBB*之大乱斗 ** **\r\n\r\n** S:F486P强者之证 ** \r\nS:F486P已经快要成为XBB*的身份象征，现在XBB*中不带这个突变的几乎没有呼吸权。\r\n\r\n不少XBB*的子系通过种种方式独自获得了这个突变，取得了对其它分支的相对增长优势。 \r\n \r\n第一个拾取绑定这个突变的是XBB.1.5*，取得了巨大的成功，不过它的市场份额正在受到挑战。 \r\nXBB.1.9.1*与XBB.1.9.2*和XBB.1.5*相比有一定的增长优势，它们的刺突蛋白几乎没有区别(换句话说就是这个优势大概率来自于非刺突蛋白基因突变，比如ORF9b:I5T(T28297C)) \r\nXBB.2.3*相对于XBB.1.5*也有一定的增长优势，不过XBB.2*的刺突蛋白带的是S:D253G(A22320G)而不是XBB.1*上带的临近位点上的S:G252V(G22317T)，除此之外XBB.2.3*还带有S:P521S(C23123T)。 \r\n \r\n**S:T478R仍在增长** \r\n尽管XBB* + S:F486P的组合已经非常给力了，不过附带了S:T478R(C22995G)的分支仍然能有显著的增幅，\r\n\r\n从一月初仅1%的XBB*带有这个二次突变(从O株的S:T478K(C22995A)再到478R)，到现在大约1/3的XBB*带有它~\r\n\r\n比如：\r\n\r\n * XBB.1.16* 额外带有S:E180V(A22101T) \r\n * XBB.2.3.8* 与 XBB.2.3.11* \r\n * EG.2 (XBB.1.9.2.2) \r\n * XBB.1.5.28 \r\n \r\n**S:F456L具备潜力** \r\n根据深度突变扫描(DMS)的试验结果，预计S:F456L(T22928C或T22930A)会为XBB*提供额外的免疫逃逸能力，尽管近期的增幅不如S:T478R来得大。\r\n\r\n \r\n5月初大约有5%的XBB*携带了这个突变，包括：\r\n\r\n * FD.1.1* (XBB.1.5.15.1.1*，主要在加麻大) \r\n * XBB.1.5.10* \r\n * XBB.1.5.59* \r\n * FE.1* (XBB.1.18.1.1*，主要在巴西) \r\n * EG.5* (XBB.1.9.2.5*，主要在印尼和国内) \r\n \r\n目前尚不清楚S:F456L与S:T478R加在一起是否能产生>2的效果，\r\n\r\n毕竟具备XBB* + S:F486P + S:F456L + S:T478R这样的豪华套餐的序列目前仅测到38条，主要都来自XBB.1.16.6。 \r\n \r\n**其余带有小幅增益的突变** \r\n\r\n * **S:Q613H** (G23401T)，已经占据了约10%的XBB*，以及5%左右的XBB*+S:F486P； \r\n * **S:P521S** (C23123T)，作为XBB.2.3*的定义之一，已经占据了约5%的XBB*份额； \r\n * **S:L455F** (G22927T)与S:F456L(T22928C/T22930A)的组合具备相当大的潜力，刚刚光速得到命名的XBB.1.5.70已经在巴西强势增长。 \r\n\r\n \r\n_**\r\n拍老师的画外音：最近巴西东北部某些地区正在发生“流感样综合征”大爆发，部分城市已出现ICU爆满和医用氧气短缺，需要动用海军从其他地区紧急运送氧气。而XBB.1.5.70刚好就有可能起源于这些地区。由于巴西已几乎不检测，所以暂时没法实锤这两个情况相互有没有关联。\r\n** _ \r\n \r\n—— 各个可能带来增益的突变的比较：\r\n \r\n\r\n* * *\r\n\r\n \r\n——附赠福利，众多的XBB*之间区分的方法之韦恩图：\r\n \r\n——附赠福利， 众多的 XBB*之间区分的方法 之 特征定义突变列表 ：\r\n \r\n以上！感谢Nekromanzer老师的辛苦搬运！\r\n\r\n\r\n \r\n\r\n\r\n\r\n预览时标签不可点\r\n\r\n微信扫一扫 \r\n关注该公众号\r\n\r\n\r\n\r\n\r\n\r\n****\r\n\r\n\r\n\r\n****\r\n\r\n\r\n\r\n× 分析\r\n\r\n 收藏\r\n\r\n","Timestamp":1685116800000,"PublicKey":"0319773E4E75194DE9810E624C4B2B57BD976F8E62CF12ACC85909BABF216A6406","Signature":"3045022100CE6C28368F0D185BD24BEEF1A503384EDFEF539B8A003333819F49D6644975200220748145B7DC930E8AD8238C9AF494F01799B56012C140B5E79DC39BC6BB183065"}