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@2022-10-18 16:00:00
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@2022-10-18 16:00:00
# Omicron：毒王族谱（2022年10月16日更新）
[ 新潮沉思录 ](javascript:void\(0\);)
__ _ _ _ _
以下文章来源于拍帮主 ，作者拍老师
**拍帮主** . I told you so……
文 | 拍老师
**前言**
各位早上好中午好下午好晚上好~ 话说这几天Cornelius小哥一直在拼尽全力处理Pango委员会堆积如山的命名申请，
连雷打不动的瑞士内参《巴塞尔报告》都给鸽了…… （延迟几天而已，这波忙完了会更的 ）
Cornelius小哥的辛勤劳动成果， 就是上图所示的那一大波刚刚得到命名的Omicron家族最新徒子徒孙。 具体而言，咱们在第一期里 [
《Omicron：毒王族谱》
](http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxODI3NzY1Mg==&mid=2247497160&idx=1&sn=9d888a2e66dcbe90f108966351e1635b&chksm=c1b16eb3f6c6e7a599e655bc09af1c5c6384c10f995f019fd0540b25fdaf0ea5c8aec72d026b&scene=21#wechat_redirect)
里提到： 截止2022年9月22日， Omicron大家族（除了BA.1之外）总共 **298个** 子分支，
现在（截止2022年10月15日），这个数字已经飙升到了 **464个** …… 其中不乏阴间程度比较高的 下一任毒王潜力股，
所以咯，差不多是时候更新一下这个毒王族谱了~
话说，这个系列读起来比较枯燥，写起来也特别费时费力， 可是时不时就有老铁在后台点播，且干货含量也挺高~ 所以之后应该不会常写，但也不能不写，
暂定每个月更新一次吧。
* * *
——请首先品鉴：
↑ 照惯例，走个全局一览， 解读一嘴：
* 以上每一个小圆点代表Omicron家族的一个子分支（sublineage）；
* 由于 **BA.1** 已经彻底过气了，所以这棵树是从 **BA.2** 开始构建的，没有 **BA.1** 的位置；
* 由于现如今子分支太多，所以换成了radial diagram视角，不然用常规视角真放不下……总之，元祖版BA.2位于圆的中心，其他各个子分支离圆心越远，则突变数量越多；
* 不同颜色的小圆点分别属于各个不同的Omicron亚谱系；
* 红色的那些小圆点全部是跟Omicron相关的重组株（严格来说重组株并不应该出现在这棵演化树上，Cornelius小哥强行移花接木过来，主要是为了方便示意）
* 总之，上图距离元祖版BA.2演化距离最远的，是发生了德奥合并的XAW、XAY、XBA和XBC四款重组株，然后则是XBB子分支、BA.2.3.20子分支和BS子分支。
* * *
下面挨个品鉴一些值得关注的子毒株。
——首先是重组株系列，请品鉴：
解说解说：
* 上面一共有51种重组株，占了Pango体系下所有重组株的大部分；
* 其他没上榜重组株包括XA、XB和XC三种Omicron时代以前的重组株、XD这种只涉及BA.1的重组株，以及XE这种相对于元祖版BA.2没有氨基酸变异的重组株；
* 上图所有重组株当中，XAY、 XBB 、XBC三种的增速最猛，以至于已经分化出各自的子毒株，即：XBB.1、XBB.2、XBB.3、XBB.1.1、XAY.1、XAY.2、XBC.1、XBC.2等；
* 抗原距离最远的，则是德奥合并产物XAW，并且XAW现在仍在保持蔓延——由于XAW重灾区俄罗斯测序能力严重拉胯，所以暂时还没法评估XAW的威胁度；
* 还有一款正在迅速蔓延的重组株，由于太新，所以暂时没入选，也就是之前抢跑过的香港首发的XBD。
其中：
* 关于XBB的介绍请见 [ 《XBB》 ](http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxODI3NzY1Mg==&mid=2247497487&idx=1&sn=b66210cad605a79fc90af8cb5666d03e&chksm=c1b16c74f6c6e5620330fb172329a9198c8dbfa9af62bec193f81e3cf7ad0518a0a7c7540b12&scene=21#wechat_redirect) ；
* 关于XAY的介绍请见 [ 《近期变异株动态小结（印度·南非·特别篇）》 ](https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxODI3NzY1Mg==&mid=2247494388&idx=1&sn=360238377984ea0960c5f58a9dff5fb9&chksm=c1b1718ff6c6f8994db9ce209fd14ffb9a300b837d1cf46475746a8612af2ca02e402406a5c1&scene=21#wechat_redirect) ；
* 关于XAW的介绍则请见 [ 《巴塞尔报告（第二期）》 ](https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxODI3NzY1Mg==&mid=2247495231&idx=1&sn=1648efc1a4b6c41a9f0b5951df1bc967&chksm=c1b17544f6c6fc52d9154f1f17c6359720a28729a31cfbff2c3ba265422fc9d7c79422b7de4b&token=514274903&lang=zh_CN&scene=21#wechat_redirect) 的第八部分。
（是的咱这边儿就是这么牛鼻，各款阴间变异株刚刚冒头就已经品鉴过了）
* * *
——BA.2亚谱系下的新增成员们：
——镜头拉近：
解释解释：
* 大概率起源于菲律宾的BA.2.3.20，以及大概率起源于越南的BS.1，都是最近相对增长优势挺厉害的子分支，如今双双喜添新丁；
* 其中BA.2.3.20的子分支CM系列，值得高看一眼的是CM.3，相对于BA.2.3.20额外多出了刺突蛋白G485D；
* BS.1的子毒株BS.1.1，则相对于BS.1额外多出了刺突蛋白G257V和K356T;
* 关于BA.2.3.20的介绍请见 [ 《次世代毒王争霸赛已经揭开序幕（BQ.1.1、BA.2.3.20和XBB）》 ](https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxODI3NzY1Mg==&mid=2247497127&idx=2&sn=7cde2b23ff188803ed9a1cd524273a7c&chksm=c1b16edcf6c6e7ca2f489a778f2851424ec102bdae666895e9981cf0638be25b324d26ff9f73&token=514274903&lang=zh_CN&scene=21#wechat_redirect) ；关于BS.1的介绍则请见 [ 《巴塞尔报告（第五期，2022年9月19日）》 ](https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxODI3NzY1Mg==&mid=2247497026&idx=1&sn=6103b4527221e01b6b2e67a1daf1ff1b&chksm=c1b16e39f6c6e72f8772dc2b5bd7c27a4d594ea223171daf4baa3e9215805702d135bdd1928b&token=514274903&lang=zh_CN&scene=21#wechat_redirect) 。
* * *
——BA.2.75亚谱系下的新增成员们：
BA. 2.75 大家族继续急速扩张， 现 在已经有63号 徒子徒孙…… 上边儿红框框出来的全是上期《毒王族谱》发出来之后新增的子毒株~
其中值得关注的包括：CH.1.1、CJ.1、BM.1.1.2、CA.4，以及BN.1.1.2。
尤其是CH.1.1，免疫逃逸可能已经超过当前毒王XBB……关于这部分，之前在知识星球那边已经抢过跑了。
——请品鉴：
* * *
——BA.4亚谱系下的新增成员们：
BA.4大家族新增两员得力干将，其中BA.4.6.3按照大趋同时代天梯榜的算法的话，大致应该算是第六阶Plus级别的战力（BA.4三阶起步，再额外获得了R346T、K444N和N460K三个趋同热点突变，外加Y144-也是强力增益突变，算是个Plus）。
* * *
最夸张的可能还是BQ.1系列， 现如今已正式升级为独立的亚谱系（Nextstrain编号22E）。
——请品鉴：
解释一嘴：
* 以上所有黄色小圆点都属于BQ.1亚谱系，整整24个子毒株……其中增速最猛的，仍然是BQ.1.1，几乎属于第六阶的天花板。
* 此外，BA.5.3亚谱系下还有其他一些新丁，比如CC.1、CQ.1等。
* * *
最后是BA.5亚谱系下面其他值得关注的新战力……
——首先是BF（BA.5.2.1）子分支：
关注重点：前段时间被咱指认为“普信变异株 ” 的 **BF.7** ，多出了俩子毒株……
——前情提要：
结果咱又一次乌鸦嘴了~ BF.7的两枚子毒株之一，BF.7.2，已抽中一次大奖，喜提刺突蛋白F486P突变，
只需再抽中一次，就有可能逆天改命！
燃不燃！卷不卷！刺不刺激！
——然后 是BF之外的其他BA.5.2 子分支 ：
关注重点：CT.1。
* * *
以上，基本把这段时间新增子毒株里面阴间程度比较高的给过了一遍。 总结总结，值得关注的包括：
* 重组株里面的XBB.1、XBB.1.1、XAW、XAY.1、XBD；
* BA.2亚谱系里面的CM.3和BS.1.1；
* BA.2.75亚谱系里面的 C H.1.1、CJ.1、BM.1.1. 2、CA.4，以及BN.1.1.2；
* BQ.1亚谱系里面的BQ.1.1；
* BA.4亚谱系里面的BA.4.6.3；
* BA.5亚谱系里面的BF.7.2和CT.1。
以上就是截止2022年10月16日，Omicron大家族（除了BA.1之外的）总共464个子分支的全家福。
Cornelius小哥这棵树的传送门： https://nextstrain.org/staging/nextclade/sars-cov-2/21L
各位看图看不清楚的话，也可以自行前往nextstrain撸树。
* * *
顺便走一个最新更新的 **大趋同时代天梯榜** 呗。 老规矩，由Cov-spectrum出品，比GISAID延迟三天左右~
——请品鉴：
哦对了 ，各位 不用费心费力在表里面找BF.7了~
咱直接顺手把BF.7设置成了基线……所以你们当然找不到了
所以上表所有的子毒株（除了吊车尾的BF.7.1），都比BF.7增长得更快。 惊不惊喜意不意外？
最后，继续感谢广大宿主的肉身供奉， 让咱们 这 些搞变异株追踪的 混子，最近不得不频繁996甚至007吧。
以上，各位再会啦~
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以下文章来源于拍帮主 ，作者拍老师
**拍帮主** . I told you so……
文 | 拍老师
**前言**
各位早上好中午好下午好晚上好~ 话说这几天Cornelius小哥一直在拼尽全力处理Pango委员会堆积如山的命名申请，
连雷打不动的瑞士内参《巴塞尔报告》都给鸽了…… （延迟几天而已，这波忙完了会更的 ）
Cornelius小哥的辛勤劳动成果， 就是上图所示的那一大波刚刚得到命名的Omicron家族最新徒子徒孙。 具体而言，咱们在第一期里 [
《Omicron：毒王族谱》
](http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxODI3NzY1Mg==&mid=2247497160&idx=1&sn=9d888a2e66dcbe90f108966351e1635b&chksm=c1b16eb3f6c6e7a599e655bc09af1c5c6384c10f995f019fd0540b25fdaf0ea5c8aec72d026b&scene=21#wechat_redirect)
里提到： 截止2022年9月22日， Omicron大家族（除了BA.1之外）总共 **298个** 子分支，
现在（截止2022年10月15日），这个数字已经飙升到了 **464个** …… 其中不乏阴间程度比较高的 下一任毒王潜力股，
所以咯，差不多是时候更新一下这个毒王族谱了~
话说，这个系列读起来比较枯燥，写起来也特别费时费力， 可是时不时就有老铁在后台点播，且干货含量也挺高~ 所以之后应该不会常写，但也不能不写，
暂定每个月更新一次吧。
* * *
——请首先品鉴：
↑ 照惯例，走个全局一览， 解读一嘴：
* 以上每一个小圆点代表Omicron家族的一个子分支（sublineage）；
* 由于 **BA.1** 已经彻底过气了，所以这棵树是从 **BA.2** 开始构建的，没有 **BA.1** 的位置；
* 由于现如今子分支太多，所以换成了radial diagram视角，不然用常规视角真放不下……总之，元祖版BA.2位于圆的中心，其他各个子分支离圆心越远，则突变数量越多；
* 不同颜色的小圆点分别属于各个不同的Omicron亚谱系；
* 红色的那些小圆点全部是跟Omicron相关的重组株（严格来说重组株并不应该出现在这棵演化树上，Cornelius小哥强行移花接木过来，主要是为了方便示意）
* 总之，上图距离元祖版BA.2演化距离最远的，是发生了德奥合并的XAW、XAY、XBA和XBC四款重组株，然后则是XBB子分支、BA.2.3.20子分支和BS子分支。
* * *
下面挨个品鉴一些值得关注的子毒株。
——首先是重组株系列，请品鉴：
解说解说：
* 上面一共有51种重组株，占了Pango体系下所有重组株的大部分；
* 其他没上榜重组株包括XA、XB和XC三种Omicron时代以前的重组株、XD这种只涉及BA.1的重组株，以及XE这种相对于元祖版BA.2没有氨基酸变异的重组株；
* 上图所有重组株当中，XAY、 XBB 、XBC三种的增速最猛，以至于已经分化出各自的子毒株，即：XBB.1、XBB.2、XBB.3、XBB.1.1、XAY.1、XAY.2、XBC.1、XBC.2等；
* 抗原距离最远的，则是德奥合并产物XAW，并且XAW现在仍在保持蔓延——由于XAW重灾区俄罗斯测序能力严重拉胯，所以暂时还没法评估XAW的威胁度；
* 还有一款正在迅速蔓延的重组株，由于太新，所以暂时没入选，也就是之前抢跑过的香港首发的XBD。
其中：
* 关于XBB的介绍请见 [ 《XBB》 ](http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxODI3NzY1Mg==&mid=2247497487&idx=1&sn=b66210cad605a79fc90af8cb5666d03e&chksm=c1b16c74f6c6e5620330fb172329a9198c8dbfa9af62bec193f81e3cf7ad0518a0a7c7540b12&scene=21#wechat_redirect) ；
* 关于XAY的介绍请见 [ 《近期变异株动态小结（印度·南非·特别篇）》 ](https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxODI3NzY1Mg==&mid=2247494388&idx=1&sn=360238377984ea0960c5f58a9dff5fb9&chksm=c1b1718ff6c6f8994db9ce209fd14ffb9a300b837d1cf46475746a8612af2ca02e402406a5c1&scene=21#wechat_redirect) ；
* 关于XAW的介绍则请见 [ 《巴塞尔报告（第二期）》 ](https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxODI3NzY1Mg==&mid=2247495231&idx=1&sn=1648efc1a4b6c41a9f0b5951df1bc967&chksm=c1b17544f6c6fc52d9154f1f17c6359720a28729a31cfbff2c3ba265422fc9d7c79422b7de4b&token=514274903&lang=zh_CN&scene=21#wechat_redirect) 的第八部分。
（是的咱这边儿就是这么牛鼻，各款阴间变异株刚刚冒头就已经品鉴过了）
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——BA.2亚谱系下的新增成员们：
——镜头拉近：
解释解释：
* 大概率起源于菲律宾的BA.2.3.20，以及大概率起源于越南的BS.1，都是最近相对增长优势挺厉害的子分支，如今双双喜添新丁；
* 其中BA.2.3.20的子分支CM系列，值得高看一眼的是CM.3，相对于BA.2.3.20额外多出了刺突蛋白G485D；
* BS.1的子毒株BS.1.1，则相对于BS.1额外多出了刺突蛋白G257V和K356T;
* 关于BA.2.3.20的介绍请见 [ 《次世代毒王争霸赛已经揭开序幕（BQ.1.1、BA.2.3.20和XBB）》 ](https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxODI3NzY1Mg==&mid=2247497127&idx=2&sn=7cde2b23ff188803ed9a1cd524273a7c&chksm=c1b16edcf6c6e7ca2f489a778f2851424ec102bdae666895e9981cf0638be25b324d26ff9f73&token=514274903&lang=zh_CN&scene=21#wechat_redirect) ；关于BS.1的介绍则请见 [ 《巴塞尔报告（第五期，2022年9月19日）》 ](https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxODI3NzY1Mg==&mid=2247497026&idx=1&sn=6103b4527221e01b6b2e67a1daf1ff1b&chksm=c1b16e39f6c6e72f8772dc2b5bd7c27a4d594ea223171daf4baa3e9215805702d135bdd1928b&token=514274903&lang=zh_CN&scene=21#wechat_redirect) 。
* * *
——BA.2.75亚谱系下的新增成员们：
BA. 2.75 大家族继续急速扩张， 现 在已经有63号 徒子徒孙…… 上边儿红框框出来的全是上期《毒王族谱》发出来之后新增的子毒株~
其中值得关注的包括：CH.1.1、CJ.1、BM.1.1.2、CA.4，以及BN.1.1.2。
尤其是CH.1.1，免疫逃逸可能已经超过当前毒王XBB……关于这部分，之前在知识星球那边已经抢过跑了。
——请品鉴：
* * *
——BA.4亚谱系下的新增成员们：
BA.4大家族新增两员得力干将，其中BA.4.6.3按照大趋同时代天梯榜的算法的话，大致应该算是第六阶Plus级别的战力（BA.4三阶起步，再额外获得了R346T、K444N和N460K三个趋同热点突变，外加Y144-也是强力增益突变，算是个Plus）。
* * *
最夸张的可能还是BQ.1系列， 现如今已正式升级为独立的亚谱系（Nextstrain编号22E）。
——请品鉴：
解释一嘴：
* 以上所有黄色小圆点都属于BQ.1亚谱系，整整24个子毒株……其中增速最猛的，仍然是BQ.1.1，几乎属于第六阶的天花板。
* 此外，BA.5.3亚谱系下还有其他一些新丁，比如CC.1、CQ.1等。
* * *
最后是BA.5亚谱系下面其他值得关注的新战力……
——首先是BF（BA.5.2.1）子分支：
关注重点：前段时间被咱指认为“普信变异株 ” 的 **BF.7** ，多出了俩子毒株……
——前情提要：
结果咱又一次乌鸦嘴了~ BF.7的两枚子毒株之一，BF.7.2，已抽中一次大奖，喜提刺突蛋白F486P突变，
只需再抽中一次，就有可能逆天改命！
燃不燃！卷不卷！刺不刺激！
——然后 是BF之外的其他BA.5.2 子分支 ：
关注重点：CT.1。
* * *
以上，基本把这段时间新增子毒株里面阴间程度比较高的给过了一遍。 总结总结，值得关注的包括：
* 重组株里面的XBB.1、XBB.1.1、XAW、XAY.1、XBD；
* BA.2亚谱系里面的CM.3和BS.1.1；
* BA.2.75亚谱系里面的 C H.1.1、CJ.1、BM.1.1. 2、CA.4，以及BN.1.1.2；
* BQ.1亚谱系里面的BQ.1.1；
* BA.4亚谱系里面的BA.4.6.3；
* BA.5亚谱系里面的BF.7.2和CT.1。
以上就是截止2022年10月16日，Omicron大家族（除了BA.1之外的）总共464个子分支的全家福。
Cornelius小哥这棵树的传送门： https://nextstrain.org/staging/nextclade/sars-cov-2/21L
各位看图看不清楚的话，也可以自行前往nextstrain撸树。
* * *
顺便走一个最新更新的 **大趋同时代天梯榜** 呗。 老规矩，由Cov-spectrum出品，比GISAID延迟三天左右~
——请品鉴：
哦对了 ，各位 不用费心费力在表里面找BF.7了~
咱直接顺手把BF.7设置成了基线……所以你们当然找不到了
所以上表所有的子毒株（除了吊车尾的BF.7.1），都比BF.7增长得更快。 惊不惊喜意不意外？
最后，继续感谢广大宿主的肉身供奉， 让咱们 这 些搞变异株追踪的 混子，最近不得不频繁996甚至007吧。
以上，各位再会啦~
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